L'AAFA est composée d'une Assemblée générale; a d'un Conseil d'administration; et d'un Secrétariat. Le Conseil d'administration  est composé d'universitaires et de praticiens africains qualifiés en matière d'arbitrage international et fournit une orientation stratégique et des conseils à l'AAFA. Le Secrétariat est dirigé par un Secrétaire Général qui est un membre ex-officio du du Conseil d'Administration. Le effectue les opérations quotidiennes de l'AAFA.

L'AfAA est une association à but non lucratif dirigée par le secteur privé. Elle est l'organe de promotion du continent pour l'arbitrage international et d'autres formes de résolution de conflits internationaux.

Elle compte parmi ses membres des praticiens africains de premier plan dans le domaine de l'arbitrage international et du règlement extrajudiciaire des litiges, ainsi que des institutions et initiatives africaines en matière d'arbitrage. Son rôle est de soutenir le développement continu de l'arbitrage international en Afrique et d'améliorer et reconnaître la proéminence internationale de ses membres et de leurs activités en matière d'arbitrage international et de résolution des conflits internationaux. L'AfAA sert également de source d'information sur l'arbitrage en Afrique.